1940. Se inaugura un nuevo puente, el Puente Nicolás Avellaneda, a una distancia de sólo 100 metros.
1960. Fin del servicio.
1993-1994. Se ordena su desarme. La oposición de asociaciones de vecinos, historiadores y concejales porteños logra impedir el desguace.
1995. La ciudad de Buenos Aires lo declara sitio de interés cultural.
1999. El gobierno nacional reconoce el Puente Transbordador y sus dos riberas (Isla Maciel y La Boca) en su lista de monumentos históricos nacionales.
2005. Desde este año, la Fundación por La Boca (FXLB) se propone la puesta en valor y funcionamiento del Puente Transbordador Nicolás Avellaneda.
2011. Comienzan los trabajos para rehabilitarlo. Se pinta el exterior devolviéndole su color original gris nube.
2017. Tras sesenta años de inactividad y 6 años de obras, el transbordador vuelve a funcionar.